生信入门-单细胞分析 A-1:样品准备与文库构建

#生信 #细胞 #单细胞分析 #预处理 #文库 #测序

一、样品准备

粗略过程

  1. 细胞分离

    • 将细胞团中的细胞分离出来
    • 技术方法
      • 荧光激活细胞分选(FACS)(基于流式细胞术)
      • 微流控芯片技术
  2. 细胞捕获

    • 技术方法
    • 微滴技术(10x 平台)
    • 微孔板法

目的

将每一个细胞分离出来以便后续操作


二、文库构建和测序(以 Illumina 测序平台为例)

粗略过程

  1. 提取 RNA
    • 从每一个细胞中提取出其中的转录组
  2. 逆转录
    • 将 RNA 逆转录为 cDNA
  3. 末端修复
    • 把打断的 cDNA 两端修复为平末端
  4. 添加接头
    • 加上测序接头
  5. 桥式 PCR 扩增
  6. 测序
    • 边合成边测序(荧光测序)

目的

取得每一个细胞的基因表达情况