分子生物学 03-2 - RNA 转录的基本过程

分子生物学 03-2 - RNA 转录的基本过程

这篇文章介绍了RNA转录的基本过程,包括RNA转录与DNA复制的比较,启动子的定义和作用,以及mRNA转录的特点和基本过程,包括模板识别、转录起始、转录延伸和转录终止。

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分子生物学 第 3 章 第 2 节:RNA 转录的基本过程

3.2.1 RNA 转录与 DNA 复制的比较

比较方面

DNA 复制

RNA 转录

是否需要引物

DNA 聚合酶不可催化两个游离核苷酸的连接,因此需要一段引物

RNA 聚合酶具有从头起始转录的能力,故其催化 RNA 合成时无需引物

碱基互补状态

DNA 子链需与母链一直保持碱基互补状态

RNA 产物不与模板 DNA 保持碱基互补状态,仅形成局部的双链杂交结构。因此,多个 RNA 聚合分子可以同时转录一个基因

是否具有选择性

DNA 复制必须将整个基因组全部拷贝,并且在每个细胞周期内只复制一次

RNA 转录可选择性地复制基因组的特定部分

精确度

很精确

转录过程缺乏严谨的校正机制

模板

单双链都可以作为模板

主要以双链 DNA 为模板,RNA 或 RNA-DNA 双链杂合体不能作为模板

  • 以 DNA 序列为模板的 RNA 聚合酶主要以双链 DNA 为模板,以 4 种核苷三磷酸(NTPs)作为活性前体,并以 Mg2+ 或 Mn2+辅助因子,催化 RNA 链的起始、延伸和终止,它不需要任何引物,催化生成的产物是与 DNA 模板链相互补的 RNA

3.2.2 启动子promoter

  • 定义:一段位于结构基因 5’ 上游区的 DNA 序列,能活化 RNA 聚合酶,使之与模板 DNA 准确地相结合,并具有转录起始的特异性,是基因表达调控的上游顺式作用原件之一

  • 转录起始时基因表达的关键阶段,这一阶段的重要问题是:RNA 聚合酶与启动子的相互作用

  • 启动子的结构影响了它与 RNA 聚合酶的亲和力,从而影响了基因表达的水平

  • 转录单元transcription unit:一段从启动子开始至终止子terminator结束的 DNA 序列

    • RNA 结合酶从转录起点开始沿着模板前进,直到终止子为止,转录出一条 RNA 链

  • 转录起点:与新生 RNA 链第一个核苷酸相对应的 DNA 链上的碱基

    • 通常为一个嘌呤

  • 上游序列与下游序列

    • 上游序列upstream:转录起点前面,即 5’ 端的序列

    • 下游序列downstream:转录起点后面,即 3’ 端的序列

    • 转录起点表示为:+1

    • 上游方向依次为:-1 -2 -3……

    • 下游方向依次为:+2 +3 +4……

3.2.3 mRNA 转录的基本过程

  • mRNA 转录的特点

    • 方向:5’ -> 3’

    • 模板:DNA 模板链(反义链)

    • 酶:RNA 聚合酶

    • 原料:四种核苷三磷酸(NTPs)

    • 配对原则:碱基互补配对

    • 形成的化学键:磷酸二酯键

    • 不需要引物参与

    • 合成的 RNA 带有与 DNA 编码链(有义链)相同的序列

  • mRNA 转录的基本过程

    1. 模板识别

    2. 转录起始

    3. 转录延伸

    4. 转录终止

① 模板识别template recognition

  • 定义:RNA 聚合酶识别启动子序列并与启动子 DNA 双链特异性结合的过程

② 转录起始initiation

  • 定义:RNA 链上第一个核苷酸键(磷酸二酯键)的形成

  • 转录起始不需要引物

  • RNA 聚合酶与启动子结合后,使其附近的 DNA 双链解旋并解链,形成转录泡以促进底物核糖核苷酸与模板 DNA 的碱基配对

③ 转录延伸elongation

  • 定义:底物 NTP 被不断添加到新生 RNA 链的 3’-OH 端

  • 随着转录泡复合体与 RNA 聚合酶沿着 DNA 模板向前移动,DNA 双螺旋持续解开,暴露出新的单链 DNA 模板,新生 RNA 链的 3’ 端不断延伸,在解链区形成 RNA-DNA 杂合物

  • 在解链区后面,DNA 模板链与其原先配对的非模板链(编码链)结合重新成为双螺旋,RNA 链被逐步释放

④ 转录终止termination

  • 当 RNA 链延伸到转录终止位点时:

    • RNA 聚合酶不再形成新的磷酸二酯键

    • RNA-DNA 杂合物分离

    • 转录泡瓦解

    • DNA 恢复成双链状态

    • RNA 聚合酶和 RNA 链都被从模板上释放下来

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